Je profite d’une présentation de mes travaux de thèse que j’ai réalisée la semaine dernière au labo de l’URFM (INRA Avignon) où je suis actuellement en post-doc pour faire un article sur ces travaux qui m’ont occupés pendant près de 4 ans (et m’occupent encore aujourd’hui d’ailleurs). Donc ces travaux, dont le titre de ce post reflète au moins en partie le contenu, ce sont déroulés au CIRAD, dans l’UMR actuellement connue sous le nom d’AGAP. Je me suis intéressé, sous la responsabilité de Magali Dufour puis de Thierry Leroy (DEA puis thèse) à la structure génétique d’une espèce de caféier, qui produit le café robusta (oui vous savez, celui qui est pas très bon et super fort 😉 ).
Structure génétique, késaco? Pour faire simple, l’idée était d’aller voir à quel niveau les caféiers de cette espèce, pris dans différentes populations sur l’ensemble de la zone dans laquelle ils poussent naturellement étaient similaires ou différents. Ce n’est pas forcément une question triviale notamment quand on commence à se demander si deux caféiers pris au hasard viennent d’une même population ou de deux populations différentes. Le but était de savoir comment s’organise la diversité génétique, si des individus justement de deux populations différentes sont plus différents que deux individus d’une même population par exemple. On peut également se poser la question de savoir si la distance géographique entre les populations que l’on regarde à également une influence sur la différentiation génétique entre les individus. Bref pas mal de questions et de boulot! Je vais essayer de répondre au moins à une partie de ces questions. Pour ceux qui sont intéressés, les liens vers ma thèse et les articles publiés en relation avec ce travail, ainsi qu’un article de « vulgarisation » tiré de l’un de mes articles sur le site du CIRAD:
- ma thèse
- un article sur le site du CIRAD (en français)
- un article sur la diversité du genre Coffea
- un article sur la différentiation des populations de caféiers naturelles et cultivées en Ouganda
- un article sur la diversité et la structure génétique des populations de caféiers
- un article plus axé sur la génomique des populations de caféiers (n’hésitez pas à demander ce dont celà parle)
- un article sur la détection de liaison entre des caractères d’intérêts agronomiques et des marqueurs moléculaires
- un article sur l’histoire de l’amélioration et les perspectives de celles-ci (en français !!)
Pas le temps de développer tout de suite, j’y reviendrais très vite…